Pomimo znacznego bezpieczeństwa wstrzykiwania botoxu, w niektórych przypadkach mogą wystąpić działania niepożądane. Pacjent każdorazowo informowany jest o możliwych skutkach ubocznych. Zazwyczaj nie są one szkodliwe dla zdrowia i nie wymagają interwencji lekarskiej. Część pacjentów skarżyła się na opadanie powiek, problemy z przełykaniem, bóle głowy czy szyi. Jednym z działań niepożądanych była również niestrawność czy zgaga. Niektórzy skarżyli się na nadciśnienie, które zwykle szybko ustępowało. Do innych działań niepożądanych należy zaliczyć kaszel, ból gardła, zawroty głowy, bóle pleców, zmęczenie, nudności czy suchość w ustach i senność.
W większości przypadków objawy te ustępowały samoistnie lub na skutek zażywanych leków. Bardzo rzadko u pacjenta pojawiają się objawy alergiczne. Jest to m.in. wysypka, świąd bądź obrzęk jamy ustnej czy gardła. Jeżeli objawy nie ustępują lub są poważniejsze, należy niezwłocznie udać się po pomoc medyczną. Warto jednak pamiętać, że działania niepożądane pojawiają się bardzo rzadko.
